Conservation des espèces menacées grâce aux technologies génomiques

Le Vietnam est considéré comme l'un des hauts lieux de la biodiversité mondiale, abritant des milliers d'espèces de vertébrés rares, endémiques et gravement menacées. Cependant, la destruction rapide de leur habitat, l'exploitation illégale et le changement climatique font peser sur de nombreuses espèces le risque de disparition définitive à l'état sauvage.

Dans ce contexte, l'application des biotechnologies modernes à l'identification, la classification, le suivi et la conservation des espèces est une nécessité urgente.

La tâche scientifique « Constitution d’une base de données sur la taxonomie et la distribution de certaines espèces de vertébrés terrestres endémiques, menacées et rares au Vietnam » (Code : DTĐL.CN-64/19), présidée par le professeur associé, le Dr Le Duc Minh, mise en œuvre à l’Institut des ressources naturelles et de l’environnement de l’Université nationale du Vietnam à Hanoï, est l’une des études pionnières visant à répondre à cette exigence.

Dans le cadre du « Programme de développement des sciences fondamentales en chimie, sciences de la vie, sciences de la Terre et sciences marines pour la période 2017-2025 », cette mission vise à maîtriser les méthodes taxonomiques modernes, en combinant les recherches morphologiques, écologiques, génétiques et évolutives afin de constituer une base de données exhaustive des espèces animales endémiques et menacées du Vietnam. Cette base constitue un fondement essentiel pour la recherche et la conservation aux niveaux de l’écosystème, de l’espèce et de la biologie moléculaire, et contribue simultanément à une participation plus étroite du Vietnam à l’Initiative taxonomique mondiale de la Convention sur la diversité biologique (ITM-CDB) et au système GBIF.

L'une des contributions notables de cette mission a été le séquençage complet, pour la première fois, du génome de 10 espèces appartenant à quatre classes : les amphibiens, les reptiles, les oiseaux et les mammifères.

Le décodage de l'ADN permet non seulement d'identifier précisément les espèces, mais aussi d'approfondir notre compréhension des relations évolutives, de la structure des populations, de la diversité génétique et des risques d'extinction futurs. Il s'agit d'une avancée majeure pour la recherche sur la faune sauvage au Vietnam, où la classification reposait auparavant principalement sur la morphologie, ce qui engendrait de nombreuses confusions et des identifications imprécises.

Notamment, les résultats de l'analyse du génome du saola (Pseudoryx nghetinhensis), la rarissime « licorne asiatique », publiés dans la revue Cell, ont suscité un vif intérêt au sein de la communauté scientifique internationale. Parallèlement, la mission a publié ces résultats dans des revues de premier plan telles que Science, Nature, Nature Communications, Nature Ecology and Evolution, contribuant ainsi à affirmer l'expertise du Vietnam en matière de recherche génomique sur la scène internationale.

Parallèlement à ces recherches approfondies, l'équipe a développé un logiciel de recherche en ligne intégrant des informations taxonomiques, de distribution et génétiques sur les espèces animales endémiques et menacées. Ce système présente la particularité d'intégrer des outils bioinformatiques permettant de déterminer l'origine, les liens de parenté et la similarité génétique entre les spécimens ; un outil précieux pour les gestionnaires, les défenseurs de l'environnement, les gardes forestiers et les scientifiques.

La mission propose également un système de solutions pour la conservation, la reproduction et la gestion durable des ressources génétiques, fondé sur une analyse scientifique exhaustive, de l'écosystème à l'espèce.

Les processus de recherche, d'investigation et de suivi de la biodiversité développés par le groupe sont considérés comme proches des normes des pays développés et peuvent être largement appliqués aux activités d'investigation des ressources naturelles.

Organismes endémiques au Vietnam.

Sur le plan scientifique, cette mission ouvre une nouvelle voie à la recherche sur la faune sauvage au Vietnam, passant de l'approche morphologique traditionnelle à l'intégration de la biologie moléculaire et du big data. Les scientifiques vietnamiens maîtrisent des technologies clés telles que le séquençage du génome de nouvelle génération, l'analyse de données ADN à grande échelle, la simulation de l'évolution et la construction d'arbres phylogénétiques. Ces compétences permettent au Vietnam de rattraper son retard sur les tendances mondiales actuelles en matière de recherche sur la conservation.

En termes d'efficacité économique , la base de données contribue à améliorer la gestion et la conservation, réduisant ainsi le risque d'extinction d'espèces essentielles à l'écosystème. La disparition d'espèces clés peut engendrer un déséquilibre écologique, diminuant les services écosystémiques et affectant directement la foresterie, l'écotourisme, l'agriculture et les moyens de subsistance locaux. Ce projet contribue également à réduire le coût des analyses génomiques à l'avenir, une fois la technologie maîtrisée au Vietnam, ouvrant ainsi la voie à des applications en agriculture, médecine, conservation et biotechnologie.

Sur le plan social, la recherche contribue significativement à sensibiliser le public à la conservation des espèces menacées, participant ainsi à la pérennité des moyens de subsistance des communautés dépendantes des ressources naturelles. Parallèlement, elle vise à créer un environnement de formation pratique pour une nouvelle génération de jeunes scientifiques. De nombreux doctorants et étudiants de master ont été encadrés et formés aux compétences spécialisées en biologie moléculaire, bioinformatique et conservation, des compétences qui font défaut au Vietnam.

D'après les résultats obtenus, la mission DTĐL.CN-64/19 représente non seulement un projet de recherche scientifique, mais aussi un tournant majeur pour le Vietnam dans l'application du génie génétique à la conservation de la faune sauvage. Ce modèle de recherche reproductible contribue à la protection de la biodiversité unique du Vietnam face aux défis croissants posés par le changement climatique et la dégradation de l'environnement.

Centre de communication scientifique et technologique

Source : https://mst.gov.vn/bao-ton-loai-nguy-cap-bang-cong-nghe-he-gen-197251201152615409.htm