Η παραγωγή δεδομένων DNA θα προωθήσει τη θαλάσσια βιοτεχνολογία.

Στο πλαίσιο πολλών χωρών που επενδύουν σημαντικά σε βάσεις δεδομένων θαλάσσιας βιολογίας και σε αυτόχθονες γενετικούς πόρους, η δημιουργία μιας βάσης δεδομένων DNA για τους βιετναμέζους θαλάσσιους οργανισμούς αποτελεί σημαντικό βήμα προς την ενίσχυση της βασικής επιστημονικής ερευνητικής ικανότητας και τη δημιουργία μιας βάσης για διεπιστημονική έρευνα.

Οι επικεφαλής της Ακαδημίας Επιστήμης και Τεχνολογίας του Βιετνάμ, μαζί με επιστήμονες από τη Ρωσική Ομοσπονδία, διεξήγαγαν έρευνα και συνέλεξαν ερευνητικά δεδομένα για τη Νότια Σινική Θάλασσα. (Φωτογραφία: Hieu Lien)

Το Βιετνάμ διαθέτει άφθονους θαλάσσιους βιολογικούς πόρους, με υψηλό επίπεδο βιοποικιλότητας στην περιοχή Ινδο-Ειρηνικού. Τα θαλάσσια οικοσυστήματα καταγράφουν περίπου 11.000-12.000 είδη, συμπεριλαμβανομένων πολλών ομάδων ασπόνδυλων όπως σφουγγάρια, εχινόδερμα και μαλάκια, τα οποία αποτελούν πλούσιους βιολογικούς πόρους με σημαντικό δυναμικό, που περιέχουν φυσικές ενώσεις πολύτιμες για φαρμακευτικά προϊόντα, υλικά και θαλάσσια βιοτεχνολογία.

Συνεπώς, η δημιουργία μιας βάσης δεδομένων DNA για τους θαλάσσιους οργανισμούς όχι μόνο υποστηρίζει την ταυτοποίηση των ειδών και την έρευνα για τη βιοποικιλότητα, αλλά δημιουργεί επίσης μια κρίσιμη βάση δεδομένων για διεπιστημονικές ερευνητικές κατευθύνσεις, έχοντας στρατηγική σημασία για τη μακροπρόθεσμη ανάπτυξη της θαλάσσιας επιστήμης και τεχνολογίας.

Σύμφωνα με επιστήμονες της Ακαδημίας Επιστήμης και Τεχνολογίας του Βιετνάμ, η έρευνα για τη θαλάσσια βιολογία στο Βιετνάμ έχει επιτύχει πολλά θετικά αποτελέσματα τις τελευταίες δεκαετίες, ειδικά στη χημεία των φυσικών ενώσεων. Ωστόσο, η ακριβής ταυτοποίηση των ειδών παραμένει μια σημαντική πρόκληση λόγω του ότι πολλά είδη έχουν παρόμοια μορφολογία, γεγονός που καθιστά δύσκολη τη διάκρισή τους με παραδοσιακές μεθόδους.

Τα εργαλεία μοριακής βιολογίας, και ιδιαίτερα η μοριακή ταξινόμηση που βασίζεται στην κωδικοποίηση DNA με γραμμωτό κώδικα, έχουν γίνει αποτελεσματικές μέθοδοι για την αναγνώριση ειδών και την έρευνα για τη βιοποικιλότητα. Η μοριακή ταξινόμηση είναι μια μέθοδος αναγνώρισης ειδών με βάση συγκεκριμένες αλληλουχίες DNA ή κωδικοποίηση DNA με γραμμωτό κώδικα ενός είδους. Η ανάπτυξη της κωδικοποίησης DNA με γραμμωτό κώδικα και η δημιουργία βάσεων δεδομένων αναφοράς για τους θαλάσσιους οργανισμούς είναι ζωτικής σημασίας για την ταχεία αξιολόγηση της βιοποικιλότητας, υποστηρίζοντας την αναγνώριση αόριστων ειδών ή ελλιπών δειγμάτων, καθώς και την αναγνώριση οργανισμών σε όλα τα στάδια ανάπτυξης, συμπεριλαμβανομένων των προνυμφών. Αυτή η μέθοδος συμβάλλει επίσης στη βελτίωση της αποτελεσματικότητας της διατήρησης, στην παρακολούθηση των χωροκατακτητικών ειδών και στη διασφάλιση της αυθεντικότητας των θαλάσσιων βιολογικών πόρων.

Αυτή τη στιγμή, πολλές χώρες σε όλο τον κόσμο εφαρμόζουν προγράμματα μεγάλης κλίμακας για τη δημιουργία βιβλιοθηκών γραμμωτού κώδικα DNA για οργανισμούς παγκοσμίως. Αυτές οι βάσεις δεδομένων θεωρούνται κρίσιμη υποδομή βιολογικών δεδομένων, που εξυπηρετούν την έρευνα για τη βιοποικιλότητα, τη διαχείριση πόρων και την επιστημονική και τεχνολογική ανάπτυξη. Σύμφωνα με αυτήν την τάση, η δημιουργία μιας βάσης δεδομένων DNA για θαλάσσιους οργανισμούς στο Βιετνάμ όχι μόνο θα εξυπηρετήσει την ταξινόμηση και την αξιολόγηση της βιοποικιλότητας, αλλά θα δημιουργήσει επίσης μια βάση για την έρευνα σε φυσικές ενώσεις και θαλάσσιους γονιδιακούς πόρους.

Με βάση αυτήν την πρακτική ανάγκη, το επιστημονικό και τεχνολογικό έργο «Έρευνα για τη δημιουργία βάσης δεδομένων DNA για διάφορες ομάδες πολύτιμων θαλάσσιων ασπόνδυλων (σφουγγάρια, εχινόδερμα, μαλάκια) στο Βιετνάμ» υλοποιήθηκε την περίοδο 2023-2025 στο Ινστιτούτο Χημείας (Ακαδημία Επιστήμης και Τεχνολογίας του Βιετνάμ), με επικεφαλής τον Δρ. Tran My Linh. Πρόκειται για μία από τις πρώτες συστηματικά και ολοκληρωμένα υλοποιημένες μελέτες σε τρεις ομάδες πολύτιμων θαλάσσιων ασπόνδυλων στο Βιετνάμ.

Σύμφωνα με τον Δρ. Tran My Linh, για πρώτη φορά, δημιουργήθηκε μια βάση δεδομένων με γραμμωτό κώδικα DNA για 109 είδη που ανήκουν στις ομάδες των σφουγγαριών, των εχινόδερμων και των μαλακίων, με αλληλουχίες που επαληθεύτηκαν μέσω ενός στενού συνδυασμού μορφολογικών χαρακτηριστικών και γενετικών δεδομένων. Όλες οι χαρακτηριστικές αλληλουχίες έχουν καταχωρηθεί σε διεθνείς βάσεις δεδομένων όπως η NCBI και η BOLD (Barcode of Life Database), και τους έχουν εκχωρηθεί αναγνωριστικά BIN (Barcode Index Number - Αριθμός Ευρετηρίου Barcode).

Αξίζει να σημειωθεί ότι κάθε είδος έχει τουλάχιστον μία μοναδική αλληλουχία DNA που έχει καθιερωθεί, συμπεριλαμβανομένων ορισμένων ειδών για πρώτη φορά με δεδομένα αναφοράς στο διεθνές σύστημα. Ταυτόχρονα, η ερευνητική ομάδα δημιούργησε μια ηλεκτρονική βάση δεδομένων στη διεύθυνση www.dnabien.vn , η οποία παρέχει πληροφορίες σχετικά με τους γραμμωτούς κώδικες DNA, τα μορφολογικά χαρακτηριστικά και τις τοποθεσίες συλλογής δειγμάτων με μια δίγλωσση βιετναμέζικη-αγγλική διεπαφή.

Μια αξιοσημείωτη νέα πτυχή του έργου είναι η επέκταση της έρευνας στην αλληλούχιση και την μεταγραφική ανάλυση αρκετών θαλάσσιων ειδών με πιθανές εφαρμογές στον τομέα της ιατρικής και της φαρμακευτικής. Τα αποτελέσματα της έρευνας έχουν δημοσιευτεί σε διεθνή και εγχώρια επιστημονικά περιοδικά, συμβάλλοντας στην ενίσχυση της παρουσίας βιετναμέζικων δεδομένων θαλάσσιας βιολογίας στη διεθνή επιστημονική κοινότητα.

Σύμφωνα με τους ειδικούς, τα αποτελέσματα της έρευνας καταδεικνύουν τον κρίσιμο ρόλο της βασικής έρευνας στη διαμόρφωση επιστημονικών πλατφορμών δεδομένων για την υποστήριξη της μελλοντικής τεχνολογικής ανάπτυξης. Ενώ η κωδικοποίηση DNA με γραμμωτό κώδικα δεν είναι μια σύνθετη βασική τεχνολογία, τα δεδομένα DNA από ιθαγενείς οργανισμούς και βιβλιοθήκες βιογραμμωτών κωδίκων αντιπροσωπεύουν μια μακροπρόθεσμη στρατηγική πηγή δεδομένων, που ενδεχομένως να χρησιμεύσει ως εθνική υποδομή βιοδεδομένων για την έρευνα για τη βιοποικιλότητα, τη διαχείριση βιολογικών πόρων και την ανάπτυξη της επιστήμης και της τεχνολογίας που σχετίζονται με τους θαλάσσιους πόρους.

Τα αρχικά αποτελέσματα που αναφέρθηκαν παραπάνω συνέβαλαν στην οικοδόμηση μιας στέρεης επιστημονικής βάσης που θα εξυπηρετήσει την ανάπτυξη της θαλάσσιας επιστήμης και τεχνολογίας του Βιετνάμ κατά την επόμενη περίοδο.

NGA LIEN HIEU

Πηγή: https://nhandan.vn/tao-du-lieu-dna-thuc-day-cong-nghe-sinh-hoc-bien-post959861.html