Генерація даних ДНК сприятиме розвитку морської біотехнології.

У контексті значних інвестицій багатьох країн у морські біологічні бази даних та місцеві генні ресурси, створення бази даних ДНК для в'єтнамських морських організмів є важливим кроком до розширення можливостей фундаментальних наукових досліджень та створення основи для міждисциплінарних досліджень.

Керівники В'єтнамської академії наук і технологій разом із вченими з Російської Федерації провели обстеження та зібрали дослідницькі дані щодо Південнокитайського моря. (Фото: Хієу Ліен)

В'єтнам володіє багатими морськими біологічними ресурсами, з високим рівнем біорізноманіття в Індо-Тихоокеанському регіоні. Морські екосистеми налічують приблизно 11 000-12 000 видів, включаючи багато груп безхребетних, таких як губки, голкошкірі та молюски, які є багатими біологічними ресурсами зі значним потенціалом, що містять природні сполуки, цінні для фармацевтики, матеріалів та морської біотехнології.

Таким чином, створення бази даних ДНК морських організмів не лише підтримує ідентифікацію видів та дослідження біорізноманіття, але й створює вирішальну основу даних для міждисциплінарних напрямків досліджень, що має стратегічне значення для довгострокового розвитку морської науки та технологій.

За словами вчених В'єтнамської академії наук і технологій, дослідження морської біології у В'єтнамі досягли багатьох позитивних результатів за останні десятиліття, особливо в хімії природних сполук. Однак точна ідентифікація видів залишається серйозною проблемою через те, що багато видів мають подібну морфологію, що ускладнює їх розрізнення за допомогою традиційних методів.

Молекулярно-біологічні інструменти, особливо молекулярна класифікація на основі ДНК-баркодування, стали ефективними методами ідентифікації видів та дослідження біорізноманіття. Молекулярна класифікація – це метод ідентифікації видів на основі специфічних послідовностей ДНК або ДНК-баркодування виду. Розробка ДНК-баркодування та створення довідкових баз даних для морських організмів має вирішальне значення для швидкої оцінки біорізноманіття, підтримки ідентифікації невловимих видів або неповних зразків, а також ідентифікації організмів на всіх стадіях розвитку, включаючи личинки. Цей метод також сприяє підвищенню ефективності охорони природи, моніторингу інвазивних видів та забезпеченню автентичності морських біологічних ресурсів.

Наразі багато країн світу впроваджують масштабні програми зі створення бібліотек штрих-кодів ДНК для організмів у всьому світі. Ці бази даних вважаються важливою інфраструктурою біологічних даних, що служить дослідженню біорізноманіття, управлінню ресурсами та науково-технічному розвитку. Відповідно до цієї тенденції, створення бази даних ДНК морських організмів у В'єтнамі не лише слугуватиме класифікації та оцінці біорізноманіття, але й створить основу для дослідження природних сполук та морських генних ресурсів.

Виходячи з цієї практичної потреби, у період 2023-2025 років в Інституті хімії (В'єтнамська академія наук і технологій) під керівництвом доктора Тран Мі Ліня було реалізовано науково-технологічний проект «Дослідження щодо створення бази даних ДНК для кількох груп цінних морських безхребетних (губок, голкошкірих, молюсків) у В'єтнамі». Це одне з перших систематично та комплексно реалізованих досліджень трьох груп цінних морських безхребетних у В'єтнамі.

За словами доктора Тран Мі Ліня, вперше було створено базу даних штрих-кодів ДНК для 109 видів, що належать до груп губок, голкошкірих та молюсків, причому послідовності перевірені за допомогою тісного поєднання морфологічних характеристик та генетичних даних. Усі характерні послідовності були зареєстровані в міжнародних базах даних, таких як NCBI та BOLD (Barcode of Life Database), та їм було присвоєно ідентифікатори BIN (Barcode Index Number).

Примітно, що для кожного виду встановлено щонайменше одну унікальну послідовність ДНК, зокрема для деяких видів вперше використовуються довідкові дані в міжнародній системі. Одночасно дослідницька група створила онлайн-базу даних за адресою www.dnabien.vn , яка надає інформацію про штрих-коди ДНК, морфологічні характеристики та місця збору зразків з двомовним в'єтнамсько-англійським інтерфейсом.

Помітним новим аспектом проєкту є розширення досліджень на секвенування та транскрипційний аналіз кількох морських видів з потенційним застосуванням у галузі медицини та фармацевтики. Результати дослідження були опубліковані в міжнародних та вітчизняних наукових журналах, що сприяє підвищенню присутності в'єтнамських морських біологічних даних у міжнародній науковій спільноті.

За словами експертів, результати дослідження демонструють вирішальну роль фундаментальних досліджень у формуванні наукових платформ даних для підтримки майбутнього технологічного розвитку. Хоча ДНК-штрихкодування не є складною базовою технологією, дані ДНК місцевих організмів та бібліотеки біоштрихкодів є довгостроковим стратегічним джерелом даних, яке потенційно може слугувати національною інфраструктурою біоданих для дослідження біорізноманіття, управління біологічними ресурсами та розвитку науки і технологій, пов'язаних з морськими ресурсами.

Початкові результати, згадані вище, сприяли створенню міцної наукової основи для розвитку морської науки та технологій В'єтнаму в найближчий період.

НГА ЛЬЄН ХІЄУ

Джерело: https://nhandan.vn/tao-du-lieu-dna-thuc-day-cong-nghe-sinh-hoc-bien-post959861.html