Het genereren van DNA-gegevens zal de mariene biotechnologie vooruit helpen.

In een tijd waarin veel landen fors investeren in mariene biologische databases en inheemse genbronnen, is de oprichting van een DNA-database voor Vietnamese mariene organismen een belangrijke stap om de capaciteit voor fundamenteel wetenschappelijk onderzoek te versterken en een basis te leggen voor interdisciplinair onderzoek.

Leiders van de Vietnamese Academie voor Wetenschap en Technologie, samen met wetenschappers uit de Russische Federatie, hebben onderzoek gedaan en gegevens verzameld over de Zuid-Chinese Zee. (Foto: Hieu Lien)

Vietnam beschikt over een overvloed aan mariene biologische rijkdommen, met een hoge biodiversiteit in de Indo-Pacifische regio. Mariene ecosystemen tellen ongeveer 11.000 tot 12.000 soorten, waaronder vele ongewervelde groepen zoals sponzen, stekelhuidigen en weekdieren. Deze vormen een rijke biologische bron met een aanzienlijk potentieel, en bevatten natuurlijke verbindingen die waardevol zijn voor farmaceutische producten, materialen en mariene biotechnologie.

Het opbouwen van een DNA-database voor mariene organismen ondersteunt daarom niet alleen de identificatie van soorten en biodiversiteitsonderzoek, maar creëert ook een cruciale databasis voor interdisciplinaire onderzoeksrichtingen, wat van strategisch belang is voor de langetermijnontwikkeling van mariene wetenschap en technologie.

Volgens wetenschappers van de Vietnamese Academie voor Wetenschap en Technologie heeft het mariene biologische onderzoek in Vietnam de afgelopen decennia veel positieve resultaten geboekt, met name op het gebied van de chemie van natuurlijke verbindingen. Een nauwkeurige soortidentificatie blijft echter een grote uitdaging, omdat veel soorten een vergelijkbare morfologie hebben, waardoor ze moeilijk te onderscheiden zijn met traditionele methoden.

Moleculairbiologische methoden, met name moleculaire classificatie op basis van DNA-barcodering, zijn effectieve methoden geworden voor soortidentificatie en biodiversiteitsonderzoek. Moleculaire classificatie is een methode om soorten te identificeren op basis van specifieke DNA-sequenties of DNA-barcodering van een soort. De ontwikkeling van DNA-barcodering en het creëren van referentiedatabases voor mariene organismen is cruciaal voor een snelle beoordeling van de biodiversiteit. Het ondersteunt de identificatie van moeilijk te vinden soorten of onvolledige exemplaren, en maakt het mogelijk om organismen in alle ontwikkelingsstadia, inclusief larven, te identificeren. Deze methode draagt ​​ook bij aan het verbeteren van de efficiëntie van natuurbehoud, het monitoren van invasieve soorten en het waarborgen van de authenticiteit van mariene biologische hulpbronnen.

Momenteel voeren veel landen wereldwijd grootschalige programma's uit om DNA-barcodebibliotheken voor organismen op te bouwen. Deze databases worden beschouwd als cruciale biologische data-infrastructuur en dienen voor biodiversiteitsonderzoek, hulpbronnenbeheer en wetenschappelijke en technologische ontwikkeling. In lijn met deze trend zal de opbouw van een DNA-database voor mariene organismen in Vietnam niet alleen bijdragen aan de classificatie en beoordeling van biodiversiteit, maar ook een basis leggen voor onderzoek naar natuurlijke verbindingen en mariene genen.

Op basis van deze praktische behoefte werd in de periode 2023-2025 het wetenschappelijk-technologische project "Onderzoek naar de opbouw van een DNA-database voor verschillende groepen waardevolle mariene ongewervelden (sponzen, stekelhuidigen, weekdieren) in Vietnam" uitgevoerd aan het Instituut voor Chemie (Vietnamese Academie van Wetenschappen en Technologie), onder leiding van dr. Tran My Linh. Dit is een van de eerste systematisch en uitgebreid uitgevoerde studies naar drie groepen waardevolle mariene ongewervelden in Vietnam.

Volgens dr. Tran My Linh is er voor het eerst een DNA-barcode-database opgebouwd voor 109 soorten die behoren tot de groepen sponzen, stekelhuidigen en weekdieren. De sequenties zijn geverifieerd door een nauwe combinatie van morfologische kenmerken en genetische gegevens. Alle karakteristieke sequenties zijn geregistreerd in internationale databases zoals NCBI en BOLD (Barcode of Life Database) en hebben een BIN-identificatie (Barcode Index Number) gekregen.

Opvallend is dat van elke soort minstens één unieke DNA-sequentie is vastgesteld, waaronder enkele soorten waarvoor voor het eerst referentiegegevens beschikbaar zijn in het internationale systeem. Tegelijkertijd heeft het onderzoeksteam een ​​online database opgezet op www.dnabien.vn , met informatie over DNA-barcodes, morfologische kenmerken en locaties waar monsters zijn verzameld, via een tweetalige interface (Vietnamees-Engels).

Een opvallend nieuw aspect van het project is de uitbreiding van het onderzoek naar de sequentiebepaling en transcriptieanalyse van verschillende mariene soorten met potentiële toepassingen op het gebied van geneeskunde en farmacie. De onderzoeksresultaten zijn gepubliceerd in internationale en nationale wetenschappelijke tijdschriften, wat bijdraagt ​​aan de versterking van de aanwezigheid van Vietnamese mariene biologische gegevens in de internationale wetenschappelijke gemeenschap.

Volgens experts tonen de onderzoeksresultaten de cruciale rol aan van fundamenteel onderzoek bij het vormen van wetenschappelijke dataplatformen ter ondersteuning van toekomstige technologische ontwikkelingen. Hoewel DNA-barcodering geen complexe kerntechnologie is, vormen DNA-gegevens van inheemse organismen en biobarcodebibliotheken een strategische gegevensbron voor de lange termijn. Deze kan potentieel dienen als een nationale biodata-infrastructuur voor biodiversiteitsonderzoek, beheer van biologische hulpbronnen en de ontwikkeling van wetenschap en technologie met betrekking tot mariene hulpbronnen.

De bovengenoemde eerste resultaten hebben bijgedragen aan de opbouw van een solide wetenschappelijke basis die de ontwikkeling van de mariene wetenschap en technologie in Vietnam in de komende periode ten goede zal komen.

NGA LIEN HIEU

Bron: https://nhandan.vn/tao-du-lieu-dna-thuc-day-cong-nghe-sinh-hoc-bien-post959861.html