การบริหารจัดการกองทุนรักษาเสถียรภาพราคาสินค้าได้ถูกมอบหมายให้หน่วยงานที่เข้าร่วมหลายหน่วยงานดำเนินการ โดยมีกระทรวงการคลังเป็นผู้รับหน้าที่ดำเนินการ