Penelitian baru tentang asal-usul Covid-19 diterbitkan dari data Tiongkok

Penelitian di atas tentang asal-usul Covid-19 didasarkan pada analisis data baru yang diterbitkan oleh Pusat Pengendalian dan Pencegahan Penyakit Tiongkok (China CDC), menurut situs web News Medical Inggris pada tanggal 20 September.

Data tersebut melibatkan lebih dari 800 sampel yang dikumpulkan sejak 1 Januari 2020, di dalam dan sekitar pasar makanan laut Huanan di Wuhan, Tiongkok, dan dari genom virus yang dilaporkan dari pasien Covid-19 pada tahap awal pandemi. Studi baru ini dipublikasikan di jurnal Cell pada 19 September.

Gambar sel yang terinfeksi virus Covid-19 SARS-CoV-2 diperbesar (kuning)

"Ini adalah salah satu kumpulan data terpenting tentang asal-usul pandemi Covid-19 yang masih ada. Kami sangat bersyukur data ini masih ada dan dibagikan," ujar rekan penulis Florence Débarre dari Pusat Penelitian Ilmiah Nasional Prancis (CNRS).

Selain itu, rekan penulis Michael Worobey dari Universitas Arizona (AS) mengatakan para peneliti menganalisis data yang sangat penting yang dikumpulkan oleh CDC Tiongkok dengan cara-cara baru. "Ini adalah analisis yang otoritatif terhadap data tersebut dan menunjukkan bahwa data tersebut konsisten dengan kumpulan besar bukti lain yang kita miliki tentang bagaimana pandemi dimulai," tegas Bapak Worobey.

Bagaimana CDC Tiongkok mengambil sampel

Pada 1 Januari 2020, setelah hewan-hewan tersebut dipindahkan dan hanya beberapa jam setelah Pasar Huanan ditutup, para investigator dari Pusat Pengendalian dan Pencegahan Penyakit Tiongkok (CDC) mengunjungi pasar tersebut untuk mengumpulkan sampel. Mereka menyeka lantai, dinding, dan permukaan lain di kios-kios tersebut. Beberapa hari kemudian, mereka kembali fokus pada permukaan di kios-kios satwa liar, seperti kandang dan gerobak yang digunakan untuk memindahkan hewan, dan mengumpulkan sampel dari saluran pembuangan.

Mereka mengurutkan sampel menggunakan metatranskriptomik, suatu teknik yang bertujuan untuk memperoleh semua urutan RNA (dan juga dapat memperoleh DNA) dari semua organisme dalam sampel, termasuk virus, bakteri, tumbuhan, dan hewan.

Tim CDC Tiongkok menerbitkan data dan hasil sekuensing mereka pada tahun 2023 di jurnal Nature . Namun, makalah tersebut tidak membahas identitas pasti hewan yang ditemukan dalam data yang dapat mewakili inang perantara. CDC Tiongkok telah membagikan data sekuensing mereka di repositori terbuka.

Menurut analisis terbaru data yang dipublikasikan di jurnal Cell , virus penyebab Covid-19, SARS-CoV-2, ditemukan di beberapa kios di Pasar Huanan, termasuk anjing rakun dan musang. Dalam beberapa kasus, materi genetik dari SARS-CoV-2 dan hewan-hewan ini bahkan ditemukan dalam sampel yang sama. Spesies hewan yang tepat diidentifikasi dengan memeriksa genom mitokondria mereka dalam sampel.

Anjing rakun dianggap rentan terhadap SARS-CoV-2 dan telah membawa SARS-CoV.

Foto: Tangkapan layar The Guardian

"Banyak dari hewan-hewan ini dimusnahkan sebelum tim CDC Tiongkok tiba, jadi kami tidak memiliki bukti langsung bahwa mereka terinfeksi. Kami sedang mempelajari jejak DNA dan RNA dari hewan-hewan ini dalam sampel, dan di beberapa kandang, SARS-CoV-2 ditemukan," kata rekan penulis Débarre.

"Ini adalah hewan yang sama yang kita ketahui memfasilitasi penularan virus corona SARS pertama ke manusia pada tahun 2002. Ini adalah hal paling berbahaya yang telah dilakukan manusia – menangkap hewan liar yang sarat virus lalu bermain api dengan mengekspos mereka kepada manusia yang tinggal di pusat kota besar, di mana kepadatan penduduk yang tinggi memudahkan virus ini untuk berkembang biak," tegas Bapak Worobey.

Alasan untuk menemukan asal usul Covid-19

Tim internasional tersebut juga melakukan analisis evolusi terhadap genom virus paling awal yang dilaporkan dalam pandemi Covid-19, dan menyimpulkan genotipe leluhur yang paling mungkin dari virus yang menginfeksi manusia dan menyebabkan pandemi Covid-19. Hasilnya menunjukkan bahwa sangat sedikit orang yang terinfeksi sebelum wabah di pasar makanan laut Huanan. Hasil ini konsisten dengan penyebaran Covid-19 dari hewan ke manusia di pasar tersebut, menurut jurnal Cell.

Studi baru ini menyediakan daftar singkat hewan yang ditemukan di pasar makanan laut Huanan, yang ditemukan berdekatan atau berkaitan dengan sampel virus yang kemungkinan besar merupakan inang perantara SARS-CoV-2. Di antara hewan-hewan tersebut, anjing rakun, spesies yang rentan terhadap SARS-CoV-2 dan merupakan pembawa SARS-CoV sebelumnya, ditemukan memiliki materi genetik terbanyak dalam sampel yang diambil dari kios-kios satwa liar di pasar Huanan. Materi genetik dari musang, yang juga telah dikaitkan dengan wabah SARS-CoV pada tahun 2023, juga ditemukan di sebuah kios dengan RNA SARS-CoV-2. Spesies lain seperti tikus bambu raksasa dan landak Malaya juga ditemukan dalam sampel positif SARS-CoV-2.

Meskipun data tidak dapat membuktikan apakah satu atau lebih hewan di atas mungkin telah terinfeksi SARS-CoV-2, analisis tim memberikan daftar spesies yang jelas yang mungkin membawa SARS-CoV-2 dan informasi genetik dapat digunakan untuk membantu melacak asal-usulnya.

Para peneliti menekankan pentingnya memahami asal-usul pandemi Covid-19. "Banyak informasi yang salah tentang asal-usul SARS-CoV-2. Alasan pentingnya menemukan asal-usul SARS-CoV-2 adalah karena virus ini memengaruhi keamanan nasional dan kesehatan masyarakat, tidak hanya di Amerika Serikat tetapi di seluruh dunia . Dan kenyataannya, meskipun fokus pada keselamatan laboratorium telah meningkat sejak pandemi dimulai lebih dari empat tahun lalu, belum banyak yang dilakukan untuk mengurangi risiko terulangnya penyakit zoonosis seperti ini," Worobey memperingatkan.

Sumber: https://thanhnien.vn/cong-bo-nghien-cuu-moi-ve-nguon-goc-covid-19-tu-du-lieu-cua-trung-quoc-185240921093431147.htm