Theo đó, Vụ Tổ chức cán bộ, Bộ Y tế đề xuất, sắp xếp tổ chức lại các đơn vị sự nghiệp y tế công lập phải đảm bảo mục tiêu: giảm đầu mối, tinh gọn cơ cấu tổ chức của đơn vị, nhưng đồng thời cũng phải bảo đảm mục tiêu nâng cao hiệu lực hiệu quả hoạt động của các đơn vị để bảo đảm cung ứng các dịch vụ sự nghiệp y tế công cơ bản, thiết yếu có chất lượng ngày càng cao đáp ứng nhu cầu chăm sóc, bảo vệ sức khỏe của nhân dân.
Thực hiện việc đánh giá hiệu quả hoạt động của mô hình Trung tâm Y tế huyện đa chức năng, trên cơ sở đó kiến nghị Chính phủ kiện toàn cơ cấu tổ chức, nâng cao năng lực của hệ thống y tế cơ sở; thực hiện việc thành lập, bố trí trạm y tế theo quy mô dân số, không phụ thuộc vào địa giới hành chính.
Cũng theo Vụ Tổ chức cán bộ, cần triển khai thực hiện việc thành lập Trung tâm kiểm soát bệnh tật Trung ương, Trung tâm Kiểm soát bệnh tật vùng trên cơ sở sắp xếp đơn vị làm nhiệm vụ y tế dự phòng cấp Trung ương để hình thành hệ thống trung tâm kiểm soát dịch bệnh đồng bộ ở tất cả các cấp và kết nối với mạng lưới kiểm soát bệnh tật thế giới, nâng cao hiệu quả giám sát, phòng chống dịch bệnh.
Vụ cũng đề xuất, đổi mới, hoàn thiện cơ chế tài chính y tế, thực hiện việc tính đúng, tính đủ giá dịch vụ y tế, làm cơ sở đẩy mạnh việc thực hiện cơ chế tự chủ, tự chịu trách nhiệm của các đơn vị sự nghiệp y tế công lập, đồng thời đổi mới phương thức quản lý, nâng cao năng lực quản trị của đơn vị, bảo đảm chặt chẽ, hiệu quả, góp phần nâng cao chất lượng hoạt động cung ứng các dịch vụ sự nghiệp y tế công, đáp ứng yêu cầu của người dân và xã hội.
Trong kiến nghị, Vụ Tổ chức cán bộ đã chỉ ra cần thực hiện chế độ đãi ngộ xứng đáng đối với cán bộ, viên chức ngành y tế.
Khi xây dựng chế độ tiền lương mới theo Nghị quyết số 27-NQ/TW ngày 21/5/2018 của Hội nghị lần thứ bảy Ban chấp hành Trung ương Khóa XII, thì cần quan tâm thực hiện phụ cấp theo nghề ở mức cao nhất đối với viên chức ngành y tế (mức 30% tổng quỹ lương), xác định bậc lương khởi điểm phù hợp với thời gian đào tạo của bác sĩ (xếp bậc 2).
Đồng thời xây dựng các chế chế độ, chính sách đủ mạnh để thu hút, khuyến khích người có trình độ chuyên môn làm việc tại y tế cơ sở, các vùng sâu, vùng xa, vùng khó khăn, biên giới, hải đảo và trong các lĩnh vực y tế dự phòng, pháp y, tâm thần, lao, phong,… thực hiện duy trì chế độ, chính sách thỏa đáng đối với đội ngũ nhân viên y tế thôn bản, cô đỡ thôn bản.