Tout comme les humains, les plantes interagissent avec leur entourage. Si les personnes qui vous entourent sont plus sensibles aux infections, votre propre risque d'infection augmente, et inversement. Il en va de même pour les plantes. Lorsque différents gènes d'une même espèce végétale sont mélangés et cultivés ensemble, certaines combinaisons sont plus résistantes aux ravageurs et aux maladies. Cet effet positif sur la biodiversité est appelé résistance liée.
L'un des principaux défis de la société moderne est de concilier sécurité alimentaire, protection de l'environnement et de la biodiversité. Les ravageurs représentent une menace sérieuse pour les cultures, ce qui rend les agents chimiques tels que les pesticides importants dans la production agricole . Cependant, ces derniers peuvent réduire la biodiversité des insectes.
La question est donc de savoir quelles combinaisons de génotypes végétaux doivent être cultivées ensemble pour lutter efficacement contre les ravageurs. Si l'on choisit deux génotypes parmi 199, on obtient 19 701 combinaisons possibles. Des chercheurs de l'Université de Zurich ont développé de nouvelles méthodes de prédiction génomique utilisant des modèles physiques pour analyser les interactions entre individus au niveau génétique.
Jusqu'à présent, il n'existait aucun moyen d'analyser les régions génomiques favorisant les interactions, telles que les liens de résistance, entre plantes voisines. C'est pourquoi l'équipe de recherche a développé une nouvelle méthode d'analyse appelée Neighbor GWAS.
Cette méthode applique un modèle utilisé en physique pour analyser les interactions entre individus végétaux voisins, en évaluant les dommages causés par l'herbivorie lorsque des individus avec une séquence d'ADN génétique spécifique sont placés les uns à côté des autres, sur la base des résultats d'expériences sur le terrain.
L'analyse réalisée à l'aide de cette nouvelle méthode a révélé que de nombreux gènes étaient impliqués dans les interactions avec les individus voisins. Grâce à l'apprentissage automatique, les chercheurs ont pu prédire les dommages causés par les herbivores et identifier les combinaisons de génotypes bénéfiques associées à la résistance prévue.
L'équipe a mené une autre expérience de terrain à grande échelle sur deux ans, en cultivant environ 2 000 plantes individuelles par paires de génotypes présentant trois niveaux différents de résistance articulaire. Les résultats de cette expérience ont montré que, par rapport à la culture d'un seul génotype, le mélange de deux génotypes réduisait les dégâts causés par les herbivores de 24,8 % et 22,7 % respectivement pour les niveaux de résistance articulaire les plus élevés et les deuxièmes plus élevés.
Source : https://www.mard.gov.vn/Pages/su-dung-da-dang-bi-hoc-thay-vi-thuoc-tru-sau-co-the-lam-thiet-hai-tu-con-trung--.aspx
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