L'étude ci-dessus sur l'origine du Covid-19 est basée sur une nouvelle analyse des données publiées par le Centre chinois de contrôle et de prévention des maladies (China CDC), selon le site Web News Medical (Royaume-Uni) le 20 septembre.
Les données proviennent de plus de 800 échantillons prélevés le 1er janvier 2020 sur le marché aux fruits de mer de Huanan à Wuhan, dans la province du Hubei, en Chine, et de génomes viraux détectés chez des patients atteints de la Covid-19 aux premiers stades de la pandémie. La nouvelle étude a été publiée dans la revue Cell le 19 septembre.
Image agrandie de cellules infectées par le virus Covid-19 SARS-CoV-2 (jaune)
« Il s'agit de l'un des ensembles de données les plus importants sur les origines de la pandémie de Covid-19 encore existant. Nous sommes extrêmement reconnaissants que ces données existent et soient partagées », a déclaré Florence Débarre, co-auteure de l'étude et directrice du Centre national de la recherche scientifique (CNRS).
Par ailleurs, le co-auteur Michael Worobey, de l'Université de l'Arizona (États-Unis), a déclaré que les chercheurs ont analysé les données extrêmement importantes recueillies par les CDC chinois de manière innovante. « Il s'agit d'une analyse fiable de ces données, qui confirme le vaste corpus de preuves dont nous disposons sur le début de la pandémie », a souligné M. Worobey.
Comment le CDC chinois a prélevé des échantillons
Le 1er janvier 2020, après le retrait des animaux et quelques heures seulement après la fermeture du marché de Huanan, des enquêteurs du Centre chinois pour le contrôle et la prévention des maladies (CDC) se sont rendus sur place pour prélever des échantillons. Ils ont prélevé des échantillons sur les sols, les murs et d'autres surfaces des étals. Ils sont revenus plusieurs jours plus tard pour examiner les surfaces des étals d'animaux sauvages, comme les cages et les chariots utilisés pour déplacer les animaux, et ont prélevé des échantillons dans les égouts.
Ils ont séquencé les échantillons à l’aide de la métatranscriptomique, une technique qui capture toutes les séquences d’ARN (et peut également récupérer l’ADN) de tous les organismes de l’échantillon, y compris les virus, les bactéries, les plantes et les animaux.
L'équipe du CDC chinois a publié ses données et résultats de séquençage en 2023 dans la revue Nature . Cependant, cet article n'a pas précisé l'identité exacte des animaux identifiés dans les données, qui pourraient avoir représenté des hôtes intermédiaires. Le CDC chinois a partagé ses données de séquençage sur des bases de données ouvertes.
Selon la dernière analyse des données publiée dans la revue Cell , le virus SARS-CoV-2, responsable de la Covid-19, était présent dans plusieurs étals du marché de Huanan, notamment chez des chiens viverrins et des civettes. Dans certains cas, du matériel génétique du SARS-CoV-2 et de ces animaux a même été retrouvé dans les mêmes échantillons. L'espèce exacte des animaux a été identifiée en examinant leurs génomes mitochondriaux dans les échantillons.
On pense que les chiens viverrins sont sensibles au SRAS-CoV-2 et ont été porteurs du SRAS-CoV.
Photo : Capture d'écran The Guardian
« Beaucoup de ces animaux ont été abattus avant l'arrivée de l'équipe du CDC chinois ; nous ne pouvons donc pas avoir de preuve directe de leur infection. Nous étudions les traces d'ADN et d'ARN de ces animaux dans les échantillons et dans certains élevages où le SARS-CoV-2 a été détecté », a déclaré le co-auteur Débarre.
« Ce sont les mêmes animaux qui, comme nous le savons, ont facilité la transmission du coronavirus initial du SRAS aux humains en 2002. C'est la chose la plus dangereuse que les humains aient jamais faite : capturer des animaux sauvages chargés de virus, puis jouer avec le feu en les exposant à des humains vivant au cœur des grandes villes, où la forte densité de population facilite l'implantation de ces virus », a souligné Worobey.
Pourquoi nous devons trouver l’origine du Covid-19
L'équipe internationale a également procédé à une analyse évolutive des premiers génomes viraux signalés lors de la pandémie de Covid-19 et a déduit le génotype ancestral le plus probable du virus ayant infecté les humains et conduit à la pandémie de Covid-19. Les résultats ont montré que très peu de personnes avaient été infectées avant l'épidémie sur le marché aux fruits de mer de Huanan, un résultat cohérent avec la propagation de la Covid-19 des animaux aux humains sur ce marché, selon la revue Cell.
La nouvelle étude fournit une courte liste d'animaux trouvés sur le marché aux fruits de mer de Huanan, qui se sont révélés coexistants ou proches d'échantillons viraux pouvant représenter les hôtes intermédiaires les plus probables du SRAS-CoV-2. Parmi eux, les chiens viverrins, une espèce sensible au SRAS-CoV-2 et précédemment porteuse du SRAS-CoV, se sont révélés posséder le matériel génétique le plus important dans les échantillons prélevés sur les étals d'animaux sauvages du marché de Huanan. Du matériel génétique de civettes, également liées à une épidémie de SRAS-CoV en 2023, a également été trouvé dans un étal contenant de l'ARN du SRAS-CoV-2. D'autres espèces, comme les rats géants des bambous et les porcs-épics de Malaisie, ont également été trouvées dans des échantillons testés positifs au SRAS-CoV-2.
Bien que les données ne puissent pas prouver si un ou plusieurs des animaux ci-dessus ont pu être infectés par le SRAS-CoV-2, l'analyse de l'équipe fournit une liste claire des espèces susceptibles d'être porteuses du SRAS-CoV-2 et les informations génétiques qui peuvent être utilisées pour aider à retracer leurs origines.
Les chercheurs ont souligné l'importance de comprendre les origines de la pandémie de Covid-19. « Il y a eu beaucoup de désinformation sur les origines du SARS-CoV-2. S'il est important de les découvrir, c'est parce qu'il s'agit d'un enjeu de sécurité nationale et de santé publique, non seulement aux États-Unis, mais dans le monde entier. Et en réalité, malgré l'attention accrue portée à la sécurité des laboratoires depuis le début de la pandémie il y a plus de quatre ans, peu de mesures ont été prises pour réduire le risque qu'un événement zoonotique comme celui-ci se reproduise », a averti Worobey.
Source : https://thanhnien.vn/cong-bo-nghien-cuu-moi-ve-nguon-goc-covid-19-tu-du-lieu-cua-trung-quoc-185240921093431147.htm
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