De nouvelles recherches sur l'origine du Covid-19 publiées à partir de données chinoises

Les recherches mentionnées ci-dessus sur l'origine du Covid-19 sont basées sur une nouvelle analyse de données publiées par le Centre chinois de contrôle et de prévention des maladies (CDC chinois), selon le site web britannique News Medical le 20 septembre.

Les données proviennent de plus de 800 échantillons prélevés à partir du 1er janvier 2020 sur le marché de fruits de mer de Huanan à Wuhan, en Chine, et dans ses environs, ainsi que de génomes viraux identifiés chez des patients atteints de Covid-19 au début de la pandémie. Cette nouvelle étude a été publiée dans la revue Cell le 19 septembre.

Image agrandie de cellules infectées par le virus Covid-19 SARS-CoV-2 (jaune)

« Il s’agit de l’un des ensembles de données les plus importants sur les origines de la pandémie de Covid-19 qui subsistent encore. Nous sommes extrêmement reconnaissants que ces données aient été préservées et soient partagées », a déclaré Florence Débarre, co-auteure de l’étude et chercheuse au Centre national de la recherche scientifique (CNRS).

Par ailleurs, Michael Worobey, de l'Université d'Arizona (États-Unis), co-auteur de l'étude, a indiqué que les chercheurs avaient analysé les données cruciales recueillies par le Centre chinois de contrôle et de prévention des maladies (CDC) selon une nouvelle approche. « Il s'agit d'une analyse approfondie de ces données, qui confirme leur cohérence avec l'ensemble des nombreuses preuves dont nous disposons sur l'origine de la pandémie », a souligné M. Worobey.

Comment le CDC chinois a prélevé des échantillons

Le 1er janvier 2020, après le retrait des animaux et quelques heures seulement après la fermeture du marché de Huanan, des enquêteurs du Centre chinois de contrôle et de prévention des maladies (CDC) se sont rendus sur place pour prélever des échantillons. Ils ont effectué des prélèvements sur les sols, les murs et autres surfaces des étals. Quelques jours plus tard, ils sont revenus pour examiner de plus près les surfaces des enclos d'animaux sauvages, comme les cages et les chariots utilisés pour leur transport, et ont également prélevé des échantillons dans les égouts.

Ils ont séquencé les échantillons à l'aide de la métatranscriptomique, une technique qui vise à obtenir toutes les séquences d'ARN (et peut également obtenir l'ADN) de tous les organismes présents dans l'échantillon, y compris les virus, les bactéries, les plantes et les animaux.

L'équipe du CDC chinois a publié ses données et résultats de séquençage en 2023 dans la revue Nature . Cependant, cet article n'a pas précisé l'identité des animaux identifiés dans les données, susceptibles d'être des hôtes intermédiaires. Le CDC chinois a mis ses données de séquençage à disposition sur des plateformes de dépôt ouvertes.

D'après une analyse récente des données publiée dans la revue Cell , le virus responsable de la Covid-19, le SARS-CoV-2, était présent sur plusieurs étals du marché de Huanan, notamment chez des chiens viverrins et des civettes. Dans certains cas, du matériel génétique du SARS-CoV-2 et de ces animaux a même été retrouvé dans les mêmes échantillons. L'identification précise des espèces animales a été réalisée grâce à l'examen de leur génome mitochondrial.

On pense que les chiens viverrins sont sensibles au SARS-CoV-2 et qu'ils ont été porteurs du SARS-CoV.

Photo : Capture d'écran du Guardian

« Nombre de ces animaux ont été abattus avant l’arrivée de l’équipe du CDC chinois, nous ne pouvons donc pas avoir de preuve directe de leur infection. Nous étudions des traces d’ADN et d’ARN provenant de ces animaux dans des échantillons, et le SARS-CoV-2 a été détecté dans certains enclos », a déclaré le co-auteur Débarre.

« Ce sont les mêmes animaux qui, nous le savons, ont facilité la transmission du coronavirus du SRAS à l'homme en 2002. C'est la chose la plus dangereuse que l'homme ait faite : capturer des animaux sauvages porteurs de virus et jouer avec le feu en les exposant à des personnes vivant au cœur des grandes villes, où la forte densité de population facilite la propagation de ces virus », a souligné M. Worobey.

Raison de rechercher l'origine du Covid-19

L'équipe internationale a également réalisé une analyse évolutive du génome viral le plus ancien identifié lors de la pandémie de Covid-19 et a déduit le génotype ancestral le plus probable du virus ayant infecté les humains et conduit à la pandémie. Les résultats ont montré que très peu de personnes étaient infectées avant l'apparition du foyer épidémique au marché de fruits de mer de Huanan. Ce résultat est cohérent avec la transmission du Covid-19 des animaux aux humains sur ce marché, selon la revue Cell.

La nouvelle étude dresse une liste restreinte d'animaux trouvés sur le marché de fruits de mer de Huanan à proximité d'échantillons viraux ou en association avec ceux-ci, susceptibles d'être des hôtes intermédiaires du SARS-CoV-2. Parmi eux, le chien viverrin, une espèce sensible au SARS-CoV-2 et ayant déjà été porteur du SARS-CoV, présentait la plus grande quantité de matériel génétique dans les échantillons prélevés sur les étals d'animaux sauvages du marché de Huanan. Du matériel génétique de civettes, également liées à l'épidémie de SARS-CoV de 2023, a aussi été retrouvé sur un étal contenant de l'ARN du SARS-CoV-2. D'autres espèces, comme le rat géant des bambous et le porc-épic malais, ont également été retrouvées dans des échantillons positifs au SARS-CoV-2.

Bien que les données ne permettent pas de prouver si un ou plusieurs des animaux mentionnés ci-dessus ont pu être infectés par le SARS-CoV-2, l'analyse de l'équipe fournit une liste claire des espèces susceptibles d'être porteuses du SARS-CoV-2 et les informations génétiques peuvent être utilisées pour aider à retracer leurs origines.

Les chercheurs ont souligné l'importance de comprendre les origines de la pandémie de Covid-19. « De nombreuses informations erronées ont circulé concernant les origines du SARS-CoV-2. Il est crucial de les déterminer car cela a des répercussions sur la sécurité nationale et la santé publique, non seulement aux États-Unis, mais dans le monde entier. Or, malgré une attention accrue portée à la sécurité des laboratoires depuis le début de la pandémie il y a plus de quatre ans, peu de mesures ont été prises pour réduire le risque de réapparition d'une zoonose de ce type », a averti Worobey.

Source : https://thanhnien.vn/cong-bo-nghien-cuu-moi-ve-nguon-goc-covid-19-tu-du-lieu-cua-trung-quoc-185240921093431147.htm