« Préparez l'appareil, l'équipement de protection et c'est parti ! » Le Dr Pham Van Phuc, directeur adjoint du centre de soins intensifs de l'Hôpital central des maladies tropicales, venait à peine de terminer son discours que toute l'équipe se déplaçait déjà dans la salle de soins intensifs. Une bronchoscopie d'urgence a été réalisée immédiatement.
La femme de 40 ans gisait immobile, le corps émacié après des mois d'hospitalisation. Elle avait subi une intervention chirurgicale pour remplacer la crosse aortique dans un hôpital central, puis avait été transférée dans un hôpital provincial pour surveillance.
Cependant, le long séjour à l'hôpital a fait que les bactéries ont « pris le contrôle » de son corps comme un ennemi invisible.
À l'hôpital provincial, le patient a été diagnostiqué avec une infection à Pseudomonas aeruginosa multirésistante .
Il s'agit d'une bactérie résistante à la plupart des antibiotiques courants. Après un mois de traitement, l'état de la patiente ne s'est pas amélioré. La forte fièvre persistait, sa respiration devenait de plus en plus rapide, et elle a fini par souffrir d'un choc septique, nécessitant son transfert à l'Hôpital central des maladies tropicales.
L'endoscope a glissé profondément dans les voies respiratoires, révélant des stries de muqueuse rouge et gonflée sur l'écran.
Le Dr Phuc a expliqué : « L'objectif principal est de prélever l'échantillon le plus profond possible, à l'endroit exact de l'infection, afin d'en déterminer la cause. Ce n'est qu'en identifiant le coupable que nous pourrons choisir le traitement approprié. »
Pour les patients sous respirateur, le risque d'infection est toujours présent. Pseudomonas aeruginosa, Staphylococcus aureus résistant à la méthicilline (SARM), Klebsiella pneumoniae et Acinetobacter baumannnii sont des bactéries connues, mais aussi des germes qui hantent les médecins réanimateurs.
Ils ne se cachent pas seulement dans les voies respiratoires, mais peuvent également envahir le sang, le cerveau et les méninges, les systèmes urinaire et digestif, provoquant chez les patients une défaillance rapide de plusieurs organes.
Dans de tels cas, les tests microbiologiques et de sensibilité aux antibiotiques constituent la solution miracle. Ils permettent de déterminer quelles bactéries sont présentes, à quels antibiotiques elles sont résistantes ou sensibles, et même si elles sont porteuses de gènes de résistance.
Il s’agit d’une base importante pour que les médecins puissent élaborer un plan de traitement précis, au lieu de tâtonner dans le noir.
Ce patient de 40 ans n'est qu'un cas parmi des dizaines de cas infectieux analysés chaque jour. On y trouve des femmes âgées de plus de 80 ans atteintes de pneumonies nosocomiales à répétition, et des hommes jeunes et en bonne santé qui s'effondrent brutalement suite à une encéphalite infectieuse.
Leur point commun est la réponse : quelle bactérie est la véritable responsable ? Et quels médicaments sont encore efficaces pour la sauver ?
Destination privilégiée pour les échantillons à analyser, le Département de microbiologie et de biologie moléculaire, grâce à son équipement moderne et à la réactivité de son personnel, peut recevoir des échantillons 24h/24 et 7j/7. Cet établissement est considéré comme le « centre de traçage » des agents pathogènes.
Chaque échantillon provenant des services cliniques est traité comme un précieux « indice ». Dès réception, le technicien scanne le code pour afficher les informations du patient et garantir ainsi l'exactitude de l'échantillon. Les données sont immédiatement mises à jour dans le système, connecté à l'ensemble de l'hôpital.
Dans la boîte de transport d'échantillons, le tube sanguin et les expectorations du patient venaient d'être apportés. L'infirmière Le Thi Thuy Dung les a rapidement remis à ses collègues du laboratoire de microbiologie. L'échantillon sanguin a été mis en culture pour stimuler la croissance bactérienne dans un flacon de milieu spécial. Les expectorations ont ensuite subi un traitement pour éliminer les impuretés avant la mise en culture.
« Le plus important est de choisir le bon environnement, de cultiver les micro-organismes avec la bonne technique et de ne absolument pas laisser l'échantillon être contaminé par des micro-organismes extérieurs », a partagé Le Thi Hoa Hong, une technicienne avec de nombreuses années d'expérience.
Les opérations techniques sont réalisées avec un équipement de biosécurité. Chaque étape d'inoculation des échantillons (pouvant contenir des agents pathogènes) dans la gélose en milieu nutritif spécifique est réalisée avec précision. La tige d'inoculation est jetable et stérilisée aux rayons gamma avant tout contact avec l'échantillon.
La boîte inoculée est ensuite placée dans un incubateur où la température et l'humidité idéales sont maintenues pour leur croissance. Ce processus dure de 24 à 72 heures, voire plus, selon la croissance de chaque micro-organisme.
Après une période d'incubation, de minuscules colonies commencent à apparaître sur la plaque d'agar - des traces de bactéries.
Le technicien Hong et ses collègues ont sélectionné les colonies suspectées de causer la maladie, ont standardisé la turbidité, puis les ont saisies dans des cartes d'identification et des tests de résistance aux antibiotiques, et les ont transférées vers le système automatique compact Vitek 2.
La machine identifiera les bactéries en fonction de réactions biochimiques et effectuera simultanément des tests de sensibilité aux antibiotiques, ce qui signifie « tester » les bactéries avec une série d'antibiotiques pour déterminer quels médicaments sont encore sensibles et lesquels sont résistants.
« Les résultats montreront la concentration minimale inhibitrice (CMI), classant ainsi les bactéries comme sensibles, intermédiaires ou résistantes à chaque type d'antibiotique », a partagé le Dr Van Dinh Trang, chef du département de microbiologie et de biologie moléculaire.
Cependant, la machine ne dispose pas toujours de suffisamment d’antibiotiques pour effectuer les tests.
Selon le Dr Trang, dans le cas de souches bactériennes rares, étranges ou présentant une résistance inhabituelle, les techniciens doivent revenir à la méthode traditionnelle : utiliser des anneaux de papier pré-imbibés d'antibiotiques à une certaine concentration pour réaliser la méthode de diffusion des antibiotiques dans des plaques d'agar.
Dans la boîte de Pétri, chaque morceau de papier imbibé d'antibiotique est placé sur la surface de la gélose inoculée avec des bactéries, puis le diamètre de la zone d'inhibition est mesuré pour déterminer le niveau de sensibilité ou de résistance aux antibiotiques de cette bactérie.
L'appareil MALDI-TOF est un autre outil utile. Cette technologie d'identification des bactéries par spectre protéique permet d'obtenir des résultats en quelques minutes par échantillon.
« Chaque plateau d'identification peut contenir jusqu'à 96 échantillons différents. Grâce à cela, nous pouvons traiter des dizaines d'échantillons en une seule séance, réduisant ainsi considérablement le temps d'attente pour les patients », explique le Dr Pham Thi Dung, du Département de microbiologie et de biologie moléculaire.
Une fois l'échantillon mis en culture et identifié, le travail de l'équipe de microbiologie ne s'arrête pas. C'est alors qu'entre en scène l'étape cruciale : la lecture et l'analyse du test de sensibilité aux antibiotiques.
Sur son bureau, le Dr Pham Thi Dung observait attentivement l'écran affichant les résultats du système Vitek. Le tableau de données était rempli de symboles ; la concentration minimale inhibitrice (CMI) apparaissait à côté du nom de chaque antibiotique.
Pour chaque souche bactérienne, le système suggère automatiquement un niveau de sensibilité, intermédiaire ou de résistance. Avant d'être transmis au clinicien, tous les échantillons doivent être confirmés par le service de microbiologie pour analyse, comparaison et approbation.
« La machine ne fournit que des données brutes. Notre tâche consiste à analyser si les résultats sont raisonnables et compatibles avec les caractéristiques de ce type de bactérie. Si nous trouvons quelque chose d'inhabituel, nous devons effectuer des tests supplémentaires avec d'autres méthodes », a expliqué le Dr Dung.
Il arrive qu'une souche bactérienne se révèle résistante à la quasi-totalité des antibiotiques. Dans ce cas, les techniciens sont contraints de réaliser des tests de génotypage supplémentaires pour déterminer si la bactérie est porteuse d'un gène de résistance particulier.
Ce n’est qu’en connaissant clairement les « armes » que possèdent les bactéries que les médecins peuvent choisir le médicament qui peut les tuer ou les inhiber.
Au plus fort de l’épidémie de Covid-19, la charge de travail de ce « centre de traçage » a été multipliée par plusieurs.
« Certains jours, on mangeait et dormait presque au laboratoire. Dès que le téléphone annonçait un nouveau cas, tout le monde se mettait immédiatement en position et travaillait toute la nuit pour obtenir les résultats au plus vite », se souvient le Dr Dung.
Une fois les résultats définitifs disponibles, la médecin établira un rapport détaillé, indiquant clairement le nom de la bactérie et le niveau de sensibilité à chaque antibiotique. « J'analyse toujours selon la stratification des antibiotiques, en privilégiant les groupes de médicaments prioritaires et les groupes de médicaments préventifs, afin que les cliniciens puissent choisir l'option la plus optimale », explique le Dr Dung.
Un résultat d'analyse ne représente que quelques lignes de texte, mais derrière lui se cachent de nombreuses heures de travail minutieux et professionnel. Il peut décider si un patient est sauvé ou non.
« Nous comprenons que chaque résultat que nous fournissons n'est pas seulement une donnée scientifique, mais aussi l'espoir de vie du patient », a déclaré le Dr Dung, les yeux toujours rivés sur les cercles de diffusion d'antibiotiques sur la boîte de culture.
Une semaine après le retour des résultats de l'antibiogramme du service de microbiologie et de biologie moléculaire, la femme de 40 ans a pu s'asseoir seule pour la première fois. Elle a souri et a remercié les médecins : « Je pensais n'avoir aucune chance. »
La guérison a commencé avec les résultats du test de sensibilité aux antibiotiques envoyés en unité de soins intensifs. À partir du tableau détaillé des données sur le type de bactéries et la sensibilité et la résistance à chaque médicament, le médecin traitant a pu élaborer un schéma thérapeutique ciblé.
La bactérie Pseudomonas aeruginosa résistante aux médicaments, qui avait précédemment provoqué un choc et une forte fièvre persistante chez le patient, a finalement été maîtrisée. Les paramètres respiratoires se sont stabilisés et la fièvre a progressivement diminué.
Le jour de sa sortie, toute la famille s'est serrée dans les bras à la porte de l'hôpital. Ces joyeuses retrouvailles étaient marquées par la présence silencieuse, mais essentielle, des « chasseurs de bactéries ». Ils n'étaient pas présents au lit d'hôpital, ne tenaient ni stéthoscope ni seringue, mais chaque résultat qu'ils fournissaient contribuait à ouvrir une chance de vie à la patiente.
Source : https://dantri.com.vn/suc-khoe/ven-man-nghe-la-cua-nhung-tho-san-vi-khuan-20251014160424246.htm
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