« Préparez le matériel, les équipements de protection et mettez-vous au travail », a déclaré le Dr Pham Van Phuc, directeur adjoint du service de soins intensifs de l'Hôpital national des maladies tropicales. Aussitôt dit, aussitôt fait, toute l'équipe s'est affairée dans le service. Une bronchoscopie d'urgence a été immédiatement pratiquée.
Cette femme de 40 ans gisait immobile, le corps amaigri après des mois d'hospitalisation. Elle avait subi une opération de remplacement de la crosse aortique dans un hôpital central, puis avait été transférée à l'hôpital provincial pour surveillance.
Cependant, le long séjour à l'hôpital a permis aux bactéries de « proliférer » dans son organisme comme un ennemi invisible.
À l'hôpital provincial, le patient a reçu un diagnostic d'infection à Pseudomonas aeruginosa multirésistante .
Ce type de bactérie est résistant à la plupart des antibiotiques courants. Après un mois de traitement, l'état de la patiente ne s'est pas amélioré. La forte fièvre a persisté, sa respiration s'est accélérée et elle a finalement présenté un choc septique, nécessitant son transfert à l'Hôpital national des maladies tropicales.
L'endoscope s'est enfoncé profondément dans les voies respiratoires, révélant sur l'écran des stries de muqueuse rouge vif et gonflée.
Le Dr Phuc a expliqué : « L’objectif principal est d’obtenir un échantillon aussi profond que possible, au niveau précis de l’infection, afin d’en déterminer la cause. Ce n’est qu’une fois la cause identifiée que nous pourrons choisir un traitement ciblant cette cause profonde. »
Chez les patients sous ventilation mécanique, le risque d'infection est omniprésent. Pseudomonas aeruginosa, Staphylococcus aureus résistant à la méthicilline (SARM), Klebsiella pneumoniae et Acinetobacter baumannii sont des noms familiers, mais aussi angoissants, pour les médecins de soins intensifs.
Ils ne se cachent pas seulement dans les voies respiratoires, mais peuvent également envahir la circulation sanguine, le cerveau et les méninges, les systèmes urinaire et digestif, provoquant chez les patients une défaillance multiviscérale rapide.
Dans de tels cas, les tests microbiologiques et les tests de sensibilité aux antibiotiques sont essentiels. Ils permettent d'identifier les bactéries présentes, les antibiotiques auxquels elles sont résistantes ou sensibles, et même si ces bactéries sont porteuses de gènes de résistance aux médicaments.
Ceci est crucial pour que les médecins puissent élaborer des plans de traitement précis, au lieu de tâtonner dans le noir.
Cette patiente de 40 ans n'est qu'un exemple parmi des dizaines de cas d'infections bactériennes recensés chaque jour. On compte aussi des femmes âgées de plus de 80 ans souffrant de pneumonies nosocomiales récurrentes, et de jeunes hommes en bonne santé qui s'effondrent subitement à cause d'une encéphalite associée à une infection.
Le point commun entre tous ces patients est qu'ils ont besoin d'une réponse : quel est le véritable coupable ? Et quels médicaments sont encore efficaces pour les sauver ?
Le département de microbiologie et de biologie moléculaire, destination privilégiée des échantillons à analyser, grâce à son équipement de pointe et à l'activité intense de son personnel, peut les recevoir 24h/24 et 7j/7. Il est considéré comme un « centre de traçage » des agents pathogènes.
Chaque prélèvement provenant des services cliniques est considéré comme un indice précieux. Dès réception, les techniciens scannent le code pour afficher les informations du patient et s'assurer ainsi qu'aucun échantillon n'est confondu avec un autre. Les données sont immédiatement mises à jour dans le système et connectées à l'ensemble de l'hôpital.
Dans la boîte de transport des échantillons, les prélèvements sanguins et d'expectorations du patient venaient d'arriver. L'infirmière Le Thi Thuy Dung les a rapidement remis à ses collègues du laboratoire de microbiologie. Les échantillons sanguins ont été mis en culture afin d'amplifier la croissance bactérienne dans un milieu spécifique, tandis que les échantillons d'expectorations ont dû être traités pour éliminer les impuretés avant la mise en culture.
« Le plus important est de choisir le bon environnement, de cultiver les micro-organismes en utilisant les techniques appropriées et d'empêcher absolument toute contamination de l'échantillon par des micro-organismes supplémentaires provenant de l'extérieur », a expliqué Le Thi Hoa Hong, technicienne forte de nombreuses années d'expérience.
La procédure est réalisée dans un équipement de biosécurité, chaque étape d'inoculation de l'échantillon (pouvant contenir des agents pathogènes) dans la gélose nutritive spécifique étant effectuée avec précision. Les anses d'inoculation sont à usage unique et stérilisées par irradiation gamma avant tout contact avec l'échantillon.
Les plaques ensemencées de bactéries sont ensuite placées dans un incubateur, où la température et l'humidité sont maintenues dans des conditions optimales pour leur croissance. Ce processus dure de 24 à 72 heures, voire plus selon le taux de croissance de chaque micro-organisme.
Après la période d'incubation, de minuscules colonies commencent à apparaître sur la plaque de gélose – des traces de bactéries.
La technicienne Hong et ses collègues sélectionnent les colonies bactériennes suspectes, normalisent la turbidité, puis les saisissent dans des cartes d'identification et des systèmes de test de sensibilité aux antibiotiques, avant de les transférer au système automatisé compact Vitek 2.
La machine identifiera les bactéries en se basant sur des réactions biochimiques et effectuera simultanément un test de sensibilité aux antibiotiques, qui consiste à « tester » les bactéries contre une gamme d'antibiotiques afin de déterminer quels médicaments sont encore efficaces et lesquels sont devenus résistants.
« Les résultats indiqueront la concentration minimale inhibitrice (CMI), permettant ainsi de classer les bactéries comme sensibles, intermédiaires ou résistantes à chaque antibiotique », a expliqué le Dr Van Dinh Trang, chef du département de microbiologie et de biologie moléculaire.
Cependant, la machine ne dispose pas toujours d'assez d'antibiotiques pour les tests.
Selon le Dr Trang, pour les souches bactériennes rares ou inhabituelles, ou celles présentant une résistance inhabituelle, les techniciens doivent revenir à la méthode traditionnelle : utiliser des disques de papier pré-imbibés d’antibiotiques à une concentration spécifique pour diffuser les antibiotiques dans la plaque de gélose.
Sur une boîte de Petri, des morceaux individuels de papier imprégné d'antibiotique sont placés à la surface de la gélose contenant les bactéries, et le diamètre de la zone d'inhibition est mesuré pour déterminer le niveau de sensibilité ou de résistance aux antibiotiques des bactéries.
Un autre outil précieux est le spectromètre de masse MALDI-TOF. Cette technologie, qui exploite le spectre protéique caractéristique des bactéries, permet d'obtenir des résultats en quelques minutes seulement par échantillon.
« Chaque plateau d'identification peut contenir jusqu'à 96 échantillons différents. Cela nous permet de traiter des dizaines de spécimens en une seule séance, réduisant considérablement le temps d'attente des patients », a expliqué le Dr Pham Thi Dung du département de microbiologie et de biologie moléculaire.
Même après la mise en culture des échantillons et l'identification des micro-organismes, le travail du personnel du département de microbiologie ne s'arrête pas là. C'est alors qu'intervient l'étape cruciale : la lecture et l'analyse des tests de sensibilité aux antibiotiques.
Assise à son bureau, le Dr Pham Thi Dung fixait intensément l'écran affichant les résultats du système Vitek. Le tableau de données, dense en symboles, indiquait la CMI (concentration minimale inhibitrice) à côté du nom de chaque antibiotique.
Pour chaque type de bactérie, le système suggère automatiquement un niveau de sensibilité, de résistance intermédiaire ou de résistance. Cependant, avant d'être transmis au clinicien, tous les résultats doivent être confirmés par le personnel du laboratoire de microbiologie pour vérification, comparaison et validation.
« La machine ne fournit que des données brutes. Notre travail consiste à analyser si les résultats sont cohérents et conformes aux caractéristiques de ce type de bactérie. Si nous constatons une anomalie, nous devons effectuer des tests complémentaires à l'aide d'autres méthodes », a expliqué le Dr Dung.
Il arrive qu'une souche bactérienne présente une résistance à la plupart des antibiotiques disponibles. Dans ce cas, les techniciens doivent effectuer des tests génétiques complémentaires afin de déterminer si la bactérie porte des gènes de résistance spécifiques.
Ce n’est qu’en connaissant les « armes » spécifiques dont disposent les bactéries que les médecins peuvent choisir le bon médicament pour les tuer ou les contrer.
Au plus fort de la pandémie de Covid-19, la charge de travail de ce « centre de traçage des contacts » a été multipliée par plusieurs fois.
« Il y avait des jours où nous mangions et dormions pratiquement directement au laboratoire. Le téléphone sonnait pour un nouveau cas, et tout le monde se mettait immédiatement en place, travaillant toute la nuit pour obtenir les résultats le plus rapidement possible », se souvient le Dr Dung.
Une fois les résultats définitifs disponibles, la médecin rédige un rapport détaillé indiquant clairement le type de bactérie et sa sensibilité à chaque antibiotique. « J'analyse toujours les résultats selon un système d'antibiothérapie hiérarchisée, en identifiant les groupes de médicaments prioritaires et de secours, afin que les cliniciens puissent choisir l'option la plus appropriée », explique le Dr Dung.
Un compte rendu d'examen ne contient peut-être que quelques lignes, mais il représente des heures de travail minutieux et professionnel. Il peut déterminer si la vie d'un patient est sauvée ou non.
« Nous comprenons que chaque résultat que nous fournissons n'est pas seulement une donnée scientifique, mais aussi une lueur d'espoir pour les patients », a déclaré le Dr Dung, les yeux toujours fixés sur les cercles de diffusion des antibiotiques sur la boîte de culture.
Une semaine après avoir reçu les résultats de l'antibiogramme du service de microbiologie et de biologie moléculaire, cette femme de 40 ans a pu s'asseoir seule pour la première fois. Souriante, elle a remercié les médecins en disant : « Je pensais que je n'avais aucune chance. »
La convalescence a débuté avec l'envoi des résultats de l'antibiogramme au service de soins intensifs. Grâce à la fiche de données détaillée sur le type de bactéries et leur sensibilité/résistance à chaque antibiotique, le médecin traitant a pu élaborer un plan de traitement ciblé.
Les bactéries Pseudomonas aeruginosa, hautement résistantes aux antibiotiques et responsables d'un choc septique et d'une fièvre élevée persistante chez les patients, ont finalement été maîtrisées. Les paramètres respiratoires se sont stabilisés et la fièvre a progressivement diminué.
Le jour de sa sortie de l'hôpital, toute la famille s'est enlacée devant la porte. Ces retrouvailles joyeuses ont été rendues possibles grâce à la contribution discrète mais essentielle des « chasseurs de bactéries ». Absents au chevet des patients, sans stéthoscope ni aiguille, chacun de leurs résultats a joué un rôle décisif pour leur survie.
Source : https://dantri.com.vn/suc-khoe/ven-man-nghe-la-cua-nhung-tho-san-vi-khuan-20251014160424246.htm
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