Des scientifiques russes découvrent une nouvelle méthode pour créer des variétés de riz à haut rendement

Légende de la photo — Photo d’illustration : Jeu Hien/VNA

Comment est créé le riz du futur ?

Comme l'expliquent les experts de RSF, le code génétique des plantes est rempli de segments d'ADN répétitifs qui peuvent être localisés consécutivement ou dispersés dans tout le génome.

Les gènes transposables, également appelés « gènes sauteurs », influencent l'activité d'autres gènes et jouent un rôle important dans l'évolution des plantes, leur résistance aux maladies et aux conditions environnementales défavorables. L'intégration de gènes d'autres organismes dans ces gènes constitue une voie prometteuse pour la création de nouvelles variétés de cultures.

Au cours du cycle de vie de la plante, les « gènes sauteurs » changent tellement (mutent) que les programmes informatiques existants ne les voient plus, ce qui empêche toute modification ultérieure.

Pour surmonter cette difficulté, les scientifiques du Centre fédéral de recherche en biotechnologie de l'Académie des sciences de Russie ont développé une approche qui utilise des tables mathématiques progressivement affinées, en les comparant à de véritables sections d'ADN.

Les auteurs de l’étude confirment que, contrairement aux approches traditionnelles, leur nouvelle méthode est capable de détecter même les répétitions mutées.

Après avoir analysé le génome du riz (Oryza sativa) à l'aide du nouvel algorithme, ils ont identifié 992 739 répétitions appartenant à 79 familles différentes. Ce chiffre est supérieur de 56 % à celui identifié par l'algorithme EDTA, largement utilisé par les biologistes. Parallèlement, ces répétitions représentent 66 % du génome total du riz, dépassant ainsi les estimations précédentes.

Des tâches importantes et de vastes perspectives

« Le riz est le principal produit alimentaire, répondant aux besoins de plus d'un milliard de personnes. Il est donc crucial de développer de nouvelles variétés à haut rendement », a déclaré Evgueni Korotkov, chef du groupe d'analyse mathématique des séquences d'ADN et de protéines au Centre fédéral de recherche en biotechnologie de l'Académie des sciences de Russie. Ses propos ont été cités dans un communiqué de l'Académie des sciences de Russie.

Selon M. Korotkov, pour résoudre le problème du développement de nouvelles variétés de riz, il est nécessaire de comprendre la structure du génome du riz et d'en identifier tous les éléments génétiques mobiles. L'équipe d'experts du Centre fédéral de recherche en biotechnologie a découvert un grand nombre de séquences jusqu'alors inconnues, ce qui permet de trouver des points d'intégration efficaces d'autres gènes végétaux dans le génome du riz et de créer de nouvelles variétés.

À l'avenir, les scientifiques prévoient d'appliquer cette approche à d'autres cultures agricoles et d'affiner la méthode pour la rendre encore plus sensible. Ils prévoient notamment de créer une base de données des répétitions distribuées trouvées dans différentes cultures, qui sera ouverte à la communauté scientifique internationale et utilisée pour de futures études expérimentales.

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